Las elecciones a rector de la EHU, celebradas el 26 de noviembre de 2024, vieron al equipo de la entonces rectora Eva Ferreira obtener el 36,3% de los votos, mientras que la candidatura de Joxerramon Bengoetxea consiguió el 63,6%. Sin embargo, varios miembros del equipo perdedor han sido nombrados para cargos de relevancia, la mayoría vinculados al Partido Nacionalista Vasco (PNV) y al Gobierno Vasco.
Entre estos nombramientos se encuentra Lore Bilbao, quien fue gerente de la EHU entre 2023 y 2024 y ahora ha sido designada directora general de Osakidetza. A pesar de su especialización en Ingeniería Industrial y Gestión, esta es su primera incursión en el ámbito sanitario. Por su parte, Begoña Loza, exsubgerente de personal de la EHU, fue nombrada directora de Personas de la OSI Barrualde-Galdakao el 21 de febrero de 2025.
Asimismo, Héctor Hernando, exsubgerente del Campus de Bizkaia de la EHU, asumió el cargo de director gerente de Osatek (entidad pública dependiente del Departamento de Salud) el 31 de enero de 2025. Miren Mateo, exsubgerente del Campus de Álava, fue designada jefa de gabinete del consejero de Ciencia, Universidad e Innovación del Gobierno Vasco, Juan Ignacio Pérez Iglesias, el 11 de enero de 2025. En el gabinete de Pérez Iglesias, actualmente colaboran otros tres miembros del anterior gobierno de Ferreira en la EHU.
Gorane Agirre, quien fuera jefa de gabinete de Ferreira en la EHU, fue nombrada asesora de comunicación institucional del Departamento de Ciencia, Universidad e Innovación del Gobierno Vasco el 3 de julio de 2025. Juanjo Untzilla, exvicerrector de Transformación Digital y Comunicación, es asesor de Política y Programas en el mismo departamento desde el 20 de marzo de 2025.
Federico Recart, exrector de Profesorado e Investigadores, y director de Planificación y Plantilla desde 2012, obtuvo el cargo de director de la Agencia de Calidad del Sistema Universitario Vasco (Unibasq) el pasado noviembre. Finalmente, Juncal Gutiérrez, exvicerrectora de Euskera, Cultura e Internacionalización, fue nombrada directora del Instituto de Evaluación e Investigación del Sistema Educativo no Universitario el 22 de diciembre, y Agustin Erkizia, exvicerrector del Campus de Gipuzkoa, accedió al puesto de coordinador de Ciencia y Conocimiento del Ayuntamiento de Donostia en julio de 2025, un cargo creado por el exalcalde Eneko Goia.
